В 1805-1854, 1860-1885(1827-1837, 1867-1885 гг. - флота генерал-штаб-доктор).

Должность руководителя медицинской части на русском флоте.

Введена указом Александра I Правительствующему Сенату от 4 августа 1805 г. при передаче медицинской части из ведения Министерства внутренних дел в Министерство военно-морских сил.

Генерал-штаб-доктор флота возглавлял последовательно Медицинскую экспедицию (1805-1827), Управление флота генерал-штаб-доктора (1827-1837, 1867-1885), Гл. мед. управление (1837 - 1854), Медицинское управление (1860-1867).

Подчинен в 1805-1837 гг. - министру (см. Министр. 2) Военно-морских сил, в 1838-1854 гг. - начальникуку Главного морского штаба, в 1860-1885 гг. - управляющему Морским министерством.

Заботился о состоянии здоровья чинов флота и береговых команд и учреждений, руководил разработкой и принятием профилактических и карантинных мер для предупреждения заболеваний и эпидемий, выработкой эффективных методов лечения болезней, созданием, ремонтом, снабжением и ликвидацией госпиталей, лазаретов и аптек морского ведомства, контролировал деятельность медицинских учреждений морского ведомства, осуществлял контроль за качеством пищевых продуктов и медикаментов, заготовлявшихся для морского ведомства, за санитарным состоянием бытовых и служебных помещений и судов флота, руководил разработкой и изучением способов хранения и консервации продуктов питания, исследованиями в области диагностики и лечения болезней, разработкой и испытанием лекарственных форм и инструментов, выработкой форм отчетности о заболеваемости и смертности на флоте, осуществлял руководство организацией подготовки фельдшеров, санитаров и аптекарских учеников для морского ведомства.

В ведении Генерал-штаб-доктор флота находился весь медицинский, ветеринарный и фармацевтический персонал морского ведомства.

Высочайшим повелением с 5 мая 1854 года должность Генерал-штаб-доктор флота преобразована в должность директора Медицинского департамента, которому подчинены вновь введенные генерал-штаб-доктор Балтийского флота и генерал-штаб-доктор Черноморского флота. Вновь должность Генерал-штаб-доктор флота введена на основании указа Правительствующему Сенату от 27 январе 1860, ликвидирована на основании Положения об управлении морским ведомством от 3 июня 1885.