При сформировании Пионерного полка, согласно указа от 27 Февраля 1797 г., сформирована в Риге новая пионерная рота, которая и называлась Пионерного полка пионерная рота Капитана Дрейера (1798 – 1803 г.).

При формировании новых рот взамен выделенных из Пионерных полков в Саперный полк и согласно указа 27 Декабря 1812 г., сформированы во 2-м Пионерном полку в числе других 2 новые пионерные роты, а именно:

1803 г. Июня 15. При разделении Пионерного полка на 2 назначена в 1-й Пионерный полк и называлась 1-го Пионерного полка пионерная рота Капитана Дрейера (1803 – 1807 г.) и Капитана Тиханова (1807–1810 г.).

одна в Бобруйске из 1/3 пионерной роты Подполковника Берха, и стала называться: 2-го Пионерного полка пионерная Штабс-Капитана Ганзера 3-го (1813 г.), Капитана Лунда  –  (1813–1814 г.) и Капитана Пасынкова (1814-1815 г).

и одна в Киеве из 1 пионерной роты Подполковника князя Пхейдзе, и стала называться 2-го Пионерного полка пионерная Капитана Пасынкова (1813–1814 г.) и Капитана Мошинского (1814 – 1815 г.).

1810 г. Декабря 9. Рота передана во 2-й Пионерный полк и стала называться 2-го Пионерного полка пионерная рота –  Вакантная (1811 г.) и Капитана Орлова (1811 – 1815 г.).

1816 г. Января 11. Саперный и оба Пионерные полка расформированы, и роты их поступили на сформирование отдельных саперных и пионерных батальонов. Вышеуказанные 3 пионерные роты составили 5-й Пионерный батальона, причем одна из пионерных рот (Подполковника Орлова) была обращена в саперную. Кроме того, а состав батальона была назначена стоявшая на Аландских островах 1-го Пионерного полка пионерная рота Подполковника Люце (основана в 1806 г.), но рота эта оставлена в отделе и к батальону присоединена не была.

1817 г. Января 31. Назван 6-м Пионерным батальоном.

1818 г. Августа 21. Бывшая в отделе пионерная рота Капитана Соловьева (бывшая Подполковника Люце) окончательно выделена из батальона и обращена в военно-рабочую роту. Взамен ее при батальоне сформирована новая пионерная рота.

1822 г. Апреля 22. К батальону присоединена артиллерийская понтонная рота № 6 и названа "понтоны 6-го Пионерного батальона».

1829 г. Октября 25. Батальон назван 5-м Саперным батальоном, но оставлен в составе 1-й саперной и 3-х пионерных рот.

1832 г. Мая 6. Понтоны отчислены от Батальона в 3-й Резервный саперный батальон (в 1841 г. переименован во 2-й Резервный саперный батальон, а в 1857 г. упразднен. Ныне эти понтоны – 5-й Понтонный батальон).

1844 г. Декабря 23. 3 пионерные роты обращены в саперные.

1846 г. Января 16. 2 роты отчислены на составление 3-го Резервного Саперного батальона (ныне 11-й Саперный Императора Николая 1-го батальон) и взамен их при батальоне сформированы 2 новые роты.

1864 г. Января 28. Из 4-го Саперного батальона передан хор музыки.

1880 г. Марта 7. Сформирована 5-я саперная рота.

1883 г. Мая 12. Одна рота выделена на сформирование 13-го Саперного батальона и взамен ее сформирована новая.

1894 г. Августа 27. Выделено 2 роты на сформирование 14-го Саперного батальона и сформирована для батальона военно-телеграфная рота из 7-го Военно-Телеграфного парка (основан 31 Августа 1870 г. под названием 5-го военно-походного телеграфного парка, 13 Октября 1876 г. переименован в 5-й Военно-Телеграфный парк и назывался так до 12 Мая 1883 г ).